Vrodená imunita likviduje baktérie okamžite. Pomalšia adaptívna (molekuly proteínov), ktoré sa naviažu na škodlivú baktériu, čím ju označia na likvidáciu fagocytmi. Kolektívnou ochranou proti likvidácii sú polysacharidové púzdra. Vakcíny sú preto na viac typov polysacharidov. Problém nastane, ak ten polysacharid je telu vlastný.